陈根：T cell ExTRECT估算T细胞数量，高效、平衡

文|陈根

病灶病原体替代疗法并未在全球之内掀起了一波又一波的热浪，被称为乳腺癌病患的“第三次革命”。该替代疗法主要通过加派乳腺癌高血压自身的病原体系统，减弱病原体细胞膜的功用来对抗乳腺癌。

但值得注意的是，至少一小高血压需要从病原体替代疗法里受益，许多高血压对该替代疗法没有质子化。而这种现象与病灶抗体水平以及T细胞膜需求量（病原体浸润高度）密切相关。

上皮细胞膜（T lymphocyte）简称T细胞膜，是由来源于骨髓的小肠骨髓膜，在淋巴细胞里分化、发育成熟后，通过小肠和体内循环而属到全身的病原体器官和组织里发挥病原体功用。

那时候普及的乳腺癌疫苗建议书往往都需要必先断定和确认病灶细胞膜相关抗体。这些抗体，有数百种之多。正在进行里的临床试验里，差不多一半要关乎到一种或多种抗体。尽管病灶抗体水平并未可以从全遗传物质蛋白质组（WES）原始数据里大约出来，但是对病灶病原体微环境里T细胞膜需求量的预报仍然需要额外的检验原始数据。

近来，工商管理乳腺癌分析所Nicholas McGranahan领衔的分析小组在《自然现象》发表重要学术分析，他们开发了一个叫作T cell ExTRECT的工具，能单独通过病灶组织检验或体内检验WES原始数据大约病灶病原体微环境里T细胞膜需求量。

一般情况下，T细胞膜成熟过程里亦会在T细胞膜受体（TCR）蛋白质亦会愈演愈烈V(D)J改组，这就构成了一个类似于体细胞膜拷贝数变异（SCNA）的生物化学事件。而T cell ExTRECT依靠了其里程序，并且借鉴了计算SCNA的工具的原理，依靠TCRA的蛋白质组读段浅层的比值（RDR）大约病灶检验里T细胞膜的需求量。

为了证明T cell ExTRECT的恰当性，分析人员首必先分别计算了T细胞膜小肠瘤（原始数据来源于JURKAT，PEER，HPB-ALL）和珠直肠癌（来自于HCT116细胞膜系）检验里的TCRA T细胞膜%-。珠果显示，珠直肠癌里TCRA T细胞膜%-接近于0，而T细胞膜小肠瘤则接近于1，这就表明T cell ExTRECT能恰当的假定检验里是否存在T细胞膜。

此外，分析人员又与另外一个依靠DNA蛋白质组原始数据计算T细胞膜%-的类似作法进行了比较。珠果断定，在有所不同的原始数据里（TRACERx100表头），两种作法证明了的珠果有相当大的一致性，但是T cell ExTRECT有更不稳定的的乏善可陈。

未来，该新发明最大限度让高效的病患建议书快速试行。

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